Zusammenfassung
Hintergrund
Trotz zahlreicher Studien über Parodontitis, der zugrunde liegende Mechanismus bleibt das Fortschreiten der Parodontitis noch weitgehend unbekannt. Diese Studie soll einen Ausdruck haben Profilierungs Vergleich zwischen Parodontitis und normalen Kontrolle und mehr Kandidaten-Gene in Parodontitis beteiligt zu identifizieren und weitere Einblicke in die molekularen Mechanismen der Parodontitis Progression zu gewinnen.
Methoden
das Genexpressionsprofil von GSE16134, bestehend aus 241 gingivale Gewebeproben und 69 gesunden Proben als Kontrolle, die von 120 systemisch gesunden Patienten mit Parodontitis erhalten (65 mit chronischen und 55 mit aggressiver Parodontitis) wurde vom Gene Expression Omnibus (GEO) Datenbank heruntergeladen. Differentiell exprimierte Gene (DEGS) in Periodontitis Proben wurden unter Verwendung des limma Paket in R im Vergleich mit Kontrollproben untersucht. Gene Ontology (GO) und Pathway-Anreicherung Analyse auf die DegS wurden unter Verwendung von Hypergeometrische Verteilung Test. Protein-Protein-Wechselwirkung (PPI) Netzwerk der DEGS wurde mit Cytoscape konstruiert, gefolgt von der Modulauswahl aus dem PPI-Netzwerk MCODE Plugin. Außerdem Transkriptionsfaktoren (TFs) dieser DegS wurden auf TRANSFAC Datenbank identifiziert basiert, und dann wurde ein regulatorisches Netzwerk aufgebaut.
Ergebnisse
